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What?“垃圾DNA”

閱讀次數(shù):875   發(fā)布時間:2019/1/25 11:25:01

為什么在您的科研中使用“假基因”的三個理由:
蛋白質編碼DNA或“功能”基因在人類基因組中僅占2%。 至今,其余98%因共非編碼特征而被稱為“垃圾DNA”。 這個名字本身就意味著垃圾DNA是無用的,可以忽略。 然而,進一步的研究表明,實際上垃圾DNA可能對我們的基因組的功能至關重要。 例如,有沒有想過為什么人星形膠質細胞和肝細胞來源于同一受精卵,并且攜帶完全相同的遺傳信息,但它們的發(fā)育,形態(tài)和功能差別很大? 雖然部分原因在于表觀遺傳學,其中基因表達受表觀遺傳修飾如DNA甲基化調控,但一些研究人員也在尋找所謂的“垃圾DNA”中的線索。 結果發(fā)現(xiàn)了“假基因”,并揭示了它們維持正常細胞生物學的多種作用。

顯然,“假基因”是與其相應的功能基因具有高序列相似性的DNA片段,但已失去其部分或全部功能。與功能基因研究的相比,“假基因”研究還處于起步階段。 不過,您有理由認真對待您的研究中的“假基因”。

 1. “假基因”的出現(xiàn)比想象中更常見、更重要

現(xiàn)在我們普遍認為,在人類基因組中,“假基因”的數(shù)目至少與蛋白質編碼的“功能基因”的數(shù)量相當。許多基因,甚至是您的感興趣的基因,都有一個或多個相應的“假基因”。 雖然仍然被認為是垃圾DNA,但是很多“假基因”都得到轉錄,有些甚至被翻譯。證據(jù)表明,一些“假基因”的轉錄水平是至關重要的,“假基因”的失調可能誘發(fā)各種疾病和病癥的發(fā)病機制。

 2. “假基因”可能影響功能基因的表達。

如您所知,基因轉錄水平在正常細胞代謝的許多方面起決定性作用,并通過復雜的網(wǎng)絡進行嚴格調控。“假基因”也可以在這個調節(jié)中發(fā)揮作用。許多“假基因”由基因的重復事件產(chǎn)生,因此與相應的功能基因序列有高度相似性。因此,當“假基因”被轉錄時,它們與功能基因相似的mRNA可以作為競爭的內源性RNA(ceRNA)來調節(jié)相應功能基因的表達水平。

 3. 不能將“假基因”的轉錄水平與其相應的功能基因區(qū)分開來,可能會造成研究數(shù)據(jù)的假象。

雖然序列高度相似,“假基因”和相應的功能基因在細胞生物學中顯然起不同的作用,并通過不同的機制進行調控。 分別分析是獲取正確結論的先決條件。 以其高度序列相似性,通過qPCR分開它們是不容易的。 必須仔細設計引物,以確保不僅PCR高效率,而且還可以確保“假基因”或功能基因的特異性。許多時候,兩者之間的差異只是幾個核苷酸,需要專業(yè)知識才能成功進行qPCR分析。 區(qū)別較小的qPCR引物可能導致不可靠甚至錯誤的結論。

ScienCell研究實驗室開發(fā)了世界上個假基因轉錄分析qPCR試劑盒,以更好地幫助您分析假基因轉錄及其對功能基因表達的影響。我們的試劑盒保證每個引物組僅擴增指定的基因或假基因而不進行交叉擴增。無論您是否已經(jīng)考慮到假基因,或者只是在今天學習假基因,我們都向您伸出援助之手。我們的科學家將幫助確定與您的研究相關的假基因和評估它們的*jia方式。

 

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